玉溪西站為雙面站房，面積12000平方米。昆明市、玉溪市政府負責全線的征地拆遷工作并承擔征地拆遷的補償等費用，預計玉溪境內要永久征地2300畝，拆遷15萬平方米，玉溪需要籌集征地拆遷補差資金近10億元。2010年7月30日，玉溪市與滇南鐵路公司、云南省鐵路投資公司正式簽訂三方征地拆遷協(xié)議，征地拆遷即將正式啟動。2010年8月16日，昆玉鐵路擴能改造工程玉溪市鐵建辦與滇南鐵路公司簽訂《玉溪西站站房、站前廣場建設協(xié)議》，施工單位中鐵六局和中鐵二十二局已經進入施工現(xiàn)場，預計本月底，昆玉鐵路電氣化擴能改造（玉溪段）將全面開工建設。