2000年，香港特別行政區(qū)政府發(fā)布《鐵路發(fā)展策略2000》，規(guī)劃提出興建高鐵香港段（今廣深港高速鐵路香港段），線路止于九龍區(qū)，設大型客運站。2007年，根據(jù)香港運輸及房屋局規(guī)劃，香港西九龍站選址于西九龍文化區(qū)，主要原因有三點：一是西九文化區(qū)毗鄰多條鐵路線和公路干線；二是車站與西九文化區(qū)相互融合；三是配合西九龍發(fā)展成重要的商業(yè)中心。2008年，香港特別行政區(qū)行政會議決定在西九龍文化區(qū)建設香港西九龍站。2010年，香港西九龍站設計方案公布。2011年，香港西九龍站正式動工建設。2017年11月18日，廣東省政府與香港特別行政區(qū)政府簽署了《內(nèi)地與香港特別行政區(qū)簽署關(guān)于在廣深港高鐵西九龍站設立口岸實施“一地兩檢”的合作安排》。2018年4月1日，廣深港高速鐵路試運行，香港西九龍站進入調(diào)試階段；同年6月14日，香港特別行政區(qū)立法會通過《廣深港高鐵（一地兩檢）條例草案》，確定在香港西九龍站實施“一地兩檢”通關(guān)程序；同年9月1日至2日，香港西九龍站舉行對外開放活動；同年9月4日，香港西九龍站內(nèi)地口岸區(qū)正式啟用；同年9月10日，香港西九龍站開售香港至中國各地高速列車車票； 同年9月20日至2018年9月22日期間，香港西九龍站暫停售票；同年9月23日，廣深港高速鐵路香港段開通運營，香港西九龍站正式運營。