1992年4月1日，杭州東站作為原中華人民共和國(guó)鐵道部"中取華東"重點(diǎn)工程之一的杭州樞紐的配套工程正式投入使用。2008年12月27日，杭州東站擴(kuò)建工程奠基，由鐵道部、浙江省、杭州市共同出資建設(shè)。2009年，杭州東站擴(kuò)建工程被列入浙江省重點(diǎn)工程。2010年1月20日，因原滬杭高速鐵路的開工建設(shè)，杭州東站正式停辦客運(yùn)業(yè)務(wù)，并在接下來(lái)的兩年時(shí)間內(nèi)進(jìn)行原址重建。原在杭州東站辦理客運(yùn)業(yè)務(wù)的列車已被分流至杭州站和杭州南站。2010年6月1日，杭州東站鐵路樞紐成功澆筑首孔鐵路雙線現(xiàn)澆箱梁，標(biāo)志著杭州東站鐵路樞紐線上工程高性能混凝土拌和供應(yīng)生產(chǎn)大干正式拉開了序幕。2010年9月8日，杭州東站樞紐東西廣場(chǎng)綜合體項(xiàng)目一期工程開工。2010年12月17日10時(shí)，杭州東站改擴(kuò)建工程首座特大橋--浙贛繞行上行線改線特大橋順利架通，成功為杭州鐵路樞紐東站改擴(kuò)建工程全線通車的節(jié)點(diǎn)目標(biāo)奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。2010年12月21日上午8時(shí)，杭州鐵路樞紐東站擴(kuò)建工程既有德勝路公鐵立交橋正式開始拆除。2011年3月31日凌晨，杭州東站擴(kuò)建工程站場(chǎng)既有線8道成功轉(zhuǎn)入新線路3道，標(biāo)志著東站工程年內(nèi)第一次轉(zhuǎn)線任務(wù)完成。2011年4月16日前夕，杭州東站擴(kuò)建工程既有9道成功轉(zhuǎn)入新建4道，標(biāo)志著杭州東站站場(chǎng)原既有軌道轉(zhuǎn)線任務(wù)全部完成。2011年04月18日上午，滬杭高鐵東站線最后一片梁板鋪設(shè)完成，至此，上海虹橋至杭州東站高鐵全線合龍。2013年3月20日，杭州東站掛起標(biāo)識(shí)牌。2013年6月30日上午8點(diǎn)，杭州東站正式對(duì)外售票并對(duì)社會(huì)開放。2013年7月1日，杭州東站正式投入運(yùn)營(yíng)。2014年1月1日，杭州東站西廣場(chǎng)投入使用。